若い医師や勤務医の労働環境に疲弊した医師の中には、常勤の病院を持たずに非常勤医としての仕事を複数病院掛け持ちして働く医師もいます。フリーランスとして働く、アルバイトだけで収入を得ている、医師とも言えるでしょう。常勤医は勤務拘束時間が長く、休日も取りにくいため、実働を時給換算すると1,000円の壁を越えることができないことも少なくないのに対し、非常勤の場合、外来勤務で50,000~60,000円/日、健康診断のアルバイト50,000円/日、殺人的な忙しさを覚悟の上なら当直1泊10万円など高額アルバイトも存在します。こうした医師アルバイト時給は平均最低でも6,000円前後をキープしており、中には時給10,000万円を超えるものもあるため、非常勤医の方が効率的に収入を得ることができるでしょう。
しかしこの場合、非常勤=アルバイト=非正規社員となるため健康保険や年金といった社会保障がなく、自分で全額負担していかなければなりません。完全なフリーランスとして限界まで働き高い収入を得ている医師もいますが、他の一般職同様、非常勤は不安定なため仕事を失うリスクがあります。また経歴やキャリアが見えないフリーの医師に重大な仕事がくることは難しく、仕事は一般的な医師に求められる水準、職場が安定しないため自己のキャリア形成が積みにくいという点もあります。
そのため医師の多くは常勤医と非常勤医を掛け持ちし、収入面や仕事の安定性、キャリア形成のバランスを取っている医師がほとんどです。若いうちは常勤医としての給与が低く体力もあるため、非常勤医の仕事を多く入れる医師もいますが、ある程度の年齢になると常勤医プラス安定した非常勤の職を1~2ヵ所持ち、その後さらに安定性を求めて常勤医としての給与条件が良くアルバイトをする必要のない病院へシフトしていきます。特に勤務医の年収は勤務する病院による給与格差が大きく、アルバイトをどれだけしているかによっても収入が大きく変動します。